AlphaFold 之父的 Isomorphic Labs 拿下近 30 亿美元级药企合作又融资 6 亿美元， Recursion 却在并购 Exscientia 后裁员 20%、砍掉 4 条管线；英矽智能的 rentosertib 交出首个 IIa 期数据。AI 制药走到临床这一关，故事开始分化。

Google DeepMind 与 Isomorphic Labs 发布 AlphaFold 3，首次将预测范围从蛋白质结构扩展到 DNA、RNA、配体等全部生命分子及其相互作用。

AlphaFold 3 把结构预测扩展到蛋白质、核酸与配体的全分子交互，但发布时的封闭访问引发争议。两年过去，DiffDock、Boltz、Protenix 等开源阵营追到了哪一步？AF3 又有哪些被实测证实的失败模式？本文梳理截至 2026 年 10 月的格局。

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